二冲程柴油机的换气形式是由上下的进、排气儿完成的，进、排气孔的开启和关闭分别由上、下活塞控制。
工作时，两个活塞在气缸内作相对运动，燃烧室位于中部，两个活塞通过连杆与上、下曲轴连接，两曲轴通过齿轮轮连接，从一处对外输出有效功。
第一行程：活塞从下止点向上止点运动。当活塞处于下止点位置时，排气门和进气孔早已打开，储气室中的压缩空气便进人气缸内，并冲向排气门，这产生清除废气的作用，同时也使气缸内充满新空气。
当活塞由下止点向上止点运动时，进气孔首先由活塞关闭，然后排气门也关闭，空气在气缸内受到压缩。
第二行程：活塞从上止点向下止点运动。
活塞行至上止点前，喷油器将燃油喷入燃烧室中，压缩空气所产生的高温使雾化的燃油着火，燃烧所产生的压力，推动活塞下行，直到排气门再打开时为止。
燃烧后的废气在内外压力差的作用下，自行从排气门排出。活塞继续下行，当进气孔被活塞打开后，气缸内又进行扫气过程。曲轴每转一转，活塞走了两个行程就完成一个循环。
润滑方式不同
二冲程发动机有两种润滑方式，一种是混合润滑，即将润滑油混合在汽油中；另一种润滑方式是分离润滑，即利用机油泵，将润滑油打入曲轴轴颈等处，然后与新鲜混合气混合后一同进入燃烧室内烧掉。这样燃烧后形成的积炭和焦状沉积物会粘死活塞环，造成漏气，堵塞进、排气口，造成功率损失，加速曲柄连杆滚针轴承的磨损。
四冲程发动机的润滑方式也有两种：一种是飞溅润滑，即利用发动机工作时运动零件飞溅起来的油滴或油雾润滑摩擦表面；另一种润滑方式是压力润滑，依靠机油泵，将润滑油输出到配气凸轮、气门摇臂等处，然后收集回来经过过滤后循环使用，同时还能带走摩擦部件的摩擦物(如铜屑、铝屑等)。
润滑油不仅润滑了运动部件，而且还对气缸头起冷却作用，更改善了润滑条件。 相比较而言，二冲程发动机的运动部件润滑效果较差，零部件工作环境较恶劣。所以二冲程发动机比四冲程发动机寿命短，一般只有四冲程发动机寿命的1/3～1/2。
以上内容参考：百度百科-二冲程
以上内容参考：百度百科-二冲程柴油机
有两冲程的，很多船用柴油机就是两冲程的。两冲程的柴油机机械效率好，转速低。
在二冲程柴油机中，曲轴每转一转，即活塞每两个冲程就完成一个工作循环，而进气和排气过程是利用压缩及工作过程的一部分来完成的，所以二冲程柴油机的活塞没有空气泵的作用，为了排除燃烧后的废气，并把新鲜空气充满气缸，必须在柴油机上安装专用的扫气泵(增压器)。
二冲程发动机的工作原理如下：
第一冲程——活塞从下止点向上止点运动。
当活塞处于下止点时，排气阀和进气孔早已打开，贮气室l中的压缩空气便进入气缸内，并冲向排气阀，这动产生清除废气的作用，同时也使气缸内充满新空气。当活塞由下止点向上止点运动时，进气孔首先由活塞关闭，然后排气阀也关闭；空气在气缸内受到压缩。
第二冲程——活塞从上止点向下止点运动。
活塞行至上止点前，喷油器将燃油喷入燃烧室中，压缩空气所产生的高温，立刻点燃雾化的燃油，燃烧所产生的压力，推动活塞下行，直到排气阀再打开时为止。燃烧后的废气在内外压力差的作用下，自行从排气阀排出。当进气孔被活塞打开后，气缸内又进行扫气过程。曲轴每转一转，活塞走了两个冲程就完成一个循环，因此叫二冲程柴油机。
