区别在于：定义不同、举办不同、意义不同。
1、定义不同：世界园艺博览会由国际园艺生产者协会（AIPH）批准举办的国际性园艺展会；世博会由主办国政府组织或政府委托有关部门举办的有较大影响和悠久历史的国际性博览活动。参展者向世界各国展示当代的文化、科技和产业上正面影响各种生活范畴的成果。
2、举办不同：截至2014年，“世园会”共举办了30余次，基本在欧美、日本等经济发达国家举办。中国已经举办过“1999年昆明世界园艺博览会”（A1类）等；世博会的起源是中世纪欧洲商人定期的市集，市集起初只涉及经济贸易。到19世纪20年代，这种具规模的大型市集便成为博览会。
3、意义不同：世界博览会由参展国政府出资，在东道国无偿提供的场地上建造自己独立的展览馆，展示本国的产品或技术；世界展览会的会场不单是展示技术和商品，而且伴以异彩纷呈的表演，富有魅力的壮观景色，设置成日常生活中是无法体验的、充满节日气氛的空间。
百度百科-世界园艺博览会
百度百科-世博会
世界园艺博览会是一项由主办国政府组织或政府委托有关部门承办的有较大影响和悠久历史的国际性活动，是非贸易性的全球性展览会。它不同于一般的国际贸易博览会，其宗旨是促进世界各国经济、文化、科学技术的交流与发展，使每个参展国家能够利用这个机会宣传自己，向全世界展示各自在各个领域所取得的建设成就。以下为中华人民共和国已举办、正在准备之中的世界园艺博览会：
1999年昆明世界园艺博览会（AIPH/BIE A1认定）
2006年沈阳世界园艺博览会（AIPH A2/B1认定）
2010年台北国际花卉博览会（AIPH A2/B1认定）
2011年西安世界园艺博览会（AIPH A2/B1认定）
2013年锦州世界园林博览会（IFLA/AIPH A2/B1认定)
2014年青岛世界园艺博览会（AIPH A2/B1认定）
2016年唐山世界园艺博览会（AIPH A2/B1认定）
2019年北京世界园艺博览会（AIPH/BIE A1认定）
世界园艺博览会是世界博览会中的一种，共分为A1、A2、B1、B2四级。
国际展览局（BIE）将世界博览会分为注册类和认可类。注册类世界博览会是由参展国政府出资，在东道国无偿提供的场地上建造自己独立的展览馆，展示本国的产品或技术；认可类世界博览会是参展国在东道国为其准备的场地中，自己负责室内外装饰及展品设置，展出某类专业性产品。国际展览局也对国际园艺生产者协会批准的A1级世界园艺博览会进行认可。
国际园艺生产者协会评定的世界园艺博览会的级别标准如下：
A1级：
大型国际园艺展览会。这种展览会举办每年不超过1个。A1级展览会时间最短3个月，最长6个月。在展览会开幕日期前6－12年提出申请，至少有10个不同国家的参展者参加。此类展览会必须包含园艺业的所有领域。如1999年在中国昆明举办的昆明世界园艺博览会就是A1级。
A2级：
国际园艺展览会。这种展览会每年最多举办两个，当两个展会在同一个洲内举办时，它们的开幕日期至少要相隔3个月，展期最少8天，最多20天。至少有6个不同的国家参展。如2006年中国沈阳举办的沈阳世界园艺博览会是A2+B1级。
B1级 ：
长期国际性园艺展览会。这种展会每年度只能举办一届。展期最少3个月，最多6个月。
B2级 :
国内专业展示会。
自1960年在荷兰鹿特丹举办首次国际园艺博览会以来，至2011年，共举办过30次世界园艺博览会。
